MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-3

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021157	CGG	2	6	1024	1029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907349
2	NC_021157	GGCA	2	8	1048	1055	25 %	0 %	50 %	25 %	482907349
3	NC_021157	GGC	2	6	1059	1064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907349
4	NC_021157	CCTG	2	8	1079	1086	0 %	25 %	25 %	50 %	482907349
5	NC_021157	GCT	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907349
6	NC_021157	CCG	2	6	1182	1187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907349
7	NC_021157	CGG	3	9	1197	1205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907349
8	NC_021157	TTG	2	6	1229	1234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907349
9	NC_021157	GAT	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907349
10	NC_021157	CGG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907350
11	NC_021157	GCCGG	2	10	1343	1352	0 %	0 %	60 %	40 %	482907350
12	NC_021157	CTG	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907350
13	NC_021157	GAA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907350
14	NC_021157	GGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907350
15	NC_021157	GCT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907350
16	NC_021157	CGG	2	6	1763	1768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907350
17	NC_021157	AGG	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907350
18	NC_021157	TGCT	2	8	1836	1843	0 %	50 %	25 %	25 %	482907350
19	NC_021157	GGT	2	6	1912	1917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907350
20	NC_021157	CAC	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907350
21	NC_021157	G	6	6	1958	1963	0 %	0 %	100 %	0 %	482907350
22	NC_021157	GCA	3	9	2042	2050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907350
23	NC_021157	GCC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907350
24	NC_021157	GCT	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907350
25	NC_021157	TGG	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907350
26	NC_021157	GCA	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907350
27	NC_021157	AGA	2	6	2329	2334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907350
28	NC_021157	AG	3	6	2354	2359	50 %	0 %	50 %	0 %	482907350
29	NC_021157	GCG	2	6	2365	2370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907350
30	NC_021157	GCG	2	6	2386	2391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907350
31	NC_021157	CGC	2	6	2400	2405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907350
32	NC_021157	GAT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907350
33	NC_021157	AGC	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907350
34	NC_021157	CAG	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907350
35	NC_021157	ACT	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907350
36	NC_021157	GAGC	2	8	2621	2628	25 %	0 %	50 %	25 %	482907350
37	NC_021157	GCAG	2	8	2644	2651	25 %	0 %	50 %	25 %	482907350
38	NC_021157	GAGC	2	8	2663	2670	25 %	0 %	50 %	25 %	482907350
39	NC_021157	GTG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907350
40	NC_021157	GCTGGA	2	12	2749	2760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482907350
41	NC_021157	TGG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907353
42	NC_021157	TTA	2	6	3130	3135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907353
43	NC_021157	A	8	8	3260	3267	100 %	0 %	0 %	0 %	482907353
44	NC_021157	TTG	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907353
45	NC_021157	ATG	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907353
46	NC_021157	TGT	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907353
47	NC_021157	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907353
48	NC_021157	TTG	2	6	3507	3512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907353
49	NC_021157	TA	3	6	3566	3571	50 %	50 %	0 %	0 %	482907353
50	NC_021157	A	7	7	3575	3581	100 %	0 %	0 %	0 %	482907353
51	NC_021157	T	6	6	3614	3619	0 %	100 %	0 %	0 %	482907353
52	NC_021157	AAC	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907353
53	NC_021157	TGA	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907353
54	NC_021157	TAA	2	6	3671	3676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907353
55	NC_021157	TGA	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907353
56	NC_021157	T	7	7	3762	3768	0 %	100 %	0 %	0 %	482907353
57	NC_021157	TCT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907353
58	NC_021157	TAC	2	6	3812	3817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907353
59	NC_021157	ACT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907353
60	NC_021157	TAA	2	6	3904	3909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907353
61	NC_021157	ATG	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907353
62	NC_021157	T	7	7	4232	4238	0 %	100 %	0 %	0 %	482907353
63	NC_021157	ATT	2	6	4302	4307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907353
64	NC_021157	TGT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907353
65	NC_021157	TGG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907353
66	NC_021157	TGT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907353
67	NC_021157	GT	3	6	4400	4405	0 %	50 %	50 %	0 %	482907353
68	NC_021157	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907353
69	NC_021157	CTG	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907353
70	NC_021157	GAT	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907353
71	NC_021157	T	6	6	4514	4519	0 %	100 %	0 %	0 %	482907353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.